Tribus chocho-popolocas procedentes de Coapan, “Tierra de Víboras”, se establecieron en Calcahualco “Donde tiene casas circuladas”, conocido como Tehuacán Viejo.
El nombre se deriva de las voces nahuas: tetl, piedra; hua, posesivo; can, lugar; “lugar que tiene piedras”. Tal vez por estas circunstancias se trasladaron al actual asentamiento, dándole otro significado al poblado: “Lugar que tiene Dioses”.
Hallazgos arqueológicos demuestran que fue habitado por comunidades aldeanas 8500 años antes de J.C.
Xelhua, conquistador nonoalca, se posesionó de estas tierras a mediados del siglo XV. Después de la derrota de los Aztecas, el 13 de Agosto de 1521 quedó sometida a los españoles.
El 16 de Marzo de 1660 los indígenas compraron a la corona el título de la Ciudad.
Durante la guerra de Independencia fué cuartel general de varios caudillos: José María Morelos, Nicolás Bravo, Manuel Mier y Terán; fue sede del congreso de Anáhuac.
Se produce granada roja, por lo que comúnmente se denomina como “Tehuacán de las granadas”.
Por decreto que expidió la H. Legislatura del Estado, el 31 de Agosto de 1884, y para honrar la memoria de Don Juan Crisóstomo Bonilla, se le designó: Tehuacán de Juan Crisóstomo Bonilla.
El 22 de Abril de 1899 ratifican límites entre la Hacienda de Buenavista y Zongolica, Veracruz.
